Entre 2012 y 2015, la Universidad del Caribe fue la primera institución educativa de Quintana Roo en certificarse en el Modelo de Equidad de Género (MEG), estrategia dirigida por el INMUJERES. Durante los años de vigencia del MEG, se realizó una recertificación del modelo y se llevaron a cabo, políticas afirmativas que aún perduran en la Universidad:
En 2019, mediante acuerdo de la Rectoría, se constituyó el Comité de Igualdad, como estrategia para transversalizar el principio de igualdad en todas las formas de relación y procesos de la Universidad del Caribe. Está integrado por representantes de la academia y la administración, y tiene por objetivo garantizar la igualdad sustantiva de condiciones y oportunidades, para todas las personas que integran la comunidad universitaria.
En mayo de 2019 se estableció el Procedimiento para la Atención de Casos de Acoso y Hostigamiento Sexual de la Universidad del Caribe, con el acompañamiento de universidades hermanas y la asesoría jurídica de la ANUIES. Este instrumento buscaba garantizar a quienes integramos la comunidad universitaria, que podamos desempeñarnos libremente, en un ambiente libre de violencia sexual.
En marzo del 2023 la Rectoría firmó el Protocolo para prevenir, atender y sancionar la violencia de género. Este documento sustituye al Procedimiento anterior y tiene como objetivo establecer y regular las acciones en favor de la igualdad de género y los mecanismos para prevenir, atender, investigar y sancionar la violencia de género en la Universidad del Caribe. Sus disposiciones son de aplicación general y de observancia obligatoria para las y los integrantes de la comunidad universitaria.
En 2024, considerando el requerimiento normativo fundamentado en la Norma NMX-R-025-2015, requisito 5.3.3.2.1. de definir y formalizar un grupo, comisión o comité encargado de la vigencia del desarrollo e implementación de prácticas de igualdad laboral y no discriminación en el centro de trabajo, se incluye dentro del Comité de Igualdad, el subcomité de Igualdad laboral y no discriminación.